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1.
São Paulo; s.n; s.n; 2013. 100 p. tab, graf, ilus.
Thesis in Portuguese | LILACS | ID: biblio-846894

ABSTRACT

Pseudomonas aeruginosa é uma proteobactéria do grupo gama muito versátil, capaz de colonizar ambientes variados e infectar hospedeiros filogeneticamente distintos, incluindo humanos imunocomprometidos. Os fatores sigma de função extracitoplasmática (ECF) são membros de sistemas de sinalização de superfície celular (CSS), abundantes em P. aeruginosa. Vinte genes codificando fatores sigma ECF estão presentes nos genomas sequenciados de P. aeruginosa, a maioria fazendo parte de sistemas TonB relacionados à captação de ferro. Neste trabalho, seis fatores sigma pobremente caracterizados foram superexpressos na linhagem PA14 a partir de um promotor induzível por arabinose para investigar seu papel na expressão dos sistemas de dois componentes PvrSR e RcsCB, que atuam na regulação da fímbria CupD, além de sua influência no crescimento de culturas de P. aeruginosa. Não foi observado efeito positivo de nenhum dos fatores sigma testados na expressão dos sistemas de dois componentes e a superexpressão de cinco deles tampouco levou a qualquer alteração no crescimento, porém a produção de piocianina foi alterada na superexpressão de PA14_55550 e a superexpressão de PA14_26600 e PA14_46810 levou a um discreto aumento no início da formação de biofilme em PA14. Por outro lado, culturas superexpressando σx (ALB04) apresentaram um perfil alterado de lipopolissacarídeo e uma curva de crescimento bifásica, alcançando precocemente uma fase estacionária seguida de uma recuperação do crescimento até uma segunda fase estacionária. Durante a primeira fase estacionária, a maior parte das células aumenta de tamanho e morre, mas as células remanescentes retornam à morfologia selvagem e seguem para a segunda fase de crescimento exponencial. Isso não acontece devido a mutações compensatórias, uma vez que células coletadas de pontos tardios da curva e diluídas em meio novo repetem este comportamento. Apesar de trabalhos com a linhagem PAO1 associarem σx à transcrição de oprF, que codifica a principal porina não específica de Pseudomonas, nas condições dos nossos ensaios em PA14 a expressão dessa porina não foi induzida pela superexpressão de σx. Assim, os efeitos observados nessa superexpressão também não podem ser atribuídos a OprF. A transcrição de oprF em PA14 mostrou-se majoritariamente dependente da região promotora a que se atribui a ligação de σ70, ao contrário dos relatos na literatura da dependência da região de ligação a σx. Análises proteômicas foram realizadas para investigar os elementos envolvidos nesses efeitos de superexpressão de σx, o que revelou a indução de diversas enzimas envolvidas na via de biossíntese de ácidos graxos. As células superexpressando σx apresentam uma maior proporção de ácidos hexadecanoico (C16) e hexadecenoico (C16:1) e dados de anisotropia mostram uma maior fluidez da(s) membrana(s). Este trabalho é o primeiro relato de um fator sigma ECF envolvido em biossíntese de lipídeos em P. aeruginosa


Pseudomonas aeruginosa is a very versatile gammaproteobacteria, able to colonize different environments and to infect phylogenetically distinct hosts, including immunocompromised humans. The extracytoplasmic function sigma factors (ECFs) are members of cell signaling systems (CSS), abundant in P. aeruginosa. Twenty genes coding for ECF sigma factors are present in the sequenced genomes of P. aeruginosa, most of them being part of TonB systems related to iron uptake. In this work, six poorly characterized sigma factors were overexpressed in strain PA14 from an arabinose inducible promoter to investigate their role in the expression of the two-component systems PvrSR and RcsCB, which regulates CupD fimbria, and their influence in P. aeruginosa cultures growth. None of the tested sigma factors led to two-component systems upregulation and overexpression of five of them caused no change in the growth profile, but pyocyanin production was altered in PA14_55550 overexpression and PA14_26600 and PA14_46810 overexpression led to a slight increase in biofilm initiation in PA14. By the other side, cultures overexpressing σx (ALB04) presented an altered lipopolysaccharide profile and a biphasic growth curve, reaching an early stationary phase followed by a growth resuming untill a second stationary phase. During the early stationary phase, most cells swells and dies, but the remaining cells return to wild type morphology and proceed to the second exponential phase of growth. This is not due to compensatory mutations, since cells collected from late points of the curve and diluted in fresh medium repeat this behavior. Although studies with strain PAO1 associate σx with transcription of oprF, encoding the major nonspecific porin of Pseudomonas, under our experiments conditions with PA14, this porin expression is not induced by σx overexpression. Thus, the effects observed in this overexpression cannot be attributed to OprF. Transcription of oprF in PA14 proved to be mainly controlled by the σ70-dependent promoter region instead of the σx-dependent promoter region reported in the literature. Proteomic analyses were performed to investigate the elements involved in these effects of σx overexpression, which revealed the induction of several enzymes involved in fatty acids biosynthesis. Cells overexpressing σx exhibit a greater proportion of hexadecanoic (C16) and hexadecenoic (C16: 1) acids and anisotropy data show higher fluidity of the membrane (s). This work is the first report of an ECF sigma factor involved in lipid biosynthesis in P. aeruginosa


Subject(s)
Extrachromosomal Inheritance , Pseudomonas aeruginosa , Feasibility Studies , Lipids , Membrane Fluidity , Molecular Biology/methods , Sigma Factor/analysis
3.
Arq. bras. med. vet. zootec ; 59(5): 1250-1256, out. 2007. tab
Article in Portuguese | LILACS | ID: lil-471209

ABSTRACT

Dados de 769.925 animais da raça Nelore, nascidos de 1965 a 2000, em 30 regiões distintas do Brasil, foram utilizados como base de dados para desenvolvimento de um programa computacional flexível, de fácil uso, que permitisse a identificação de linhagens fundadoras de rebanhos, com filtro por país, estado, região ou rebanho. Foi escolhida a região Centro-Oeste, representativa do Brasil, para o estudo pormenorizado do efeito citoplasmático sobre característica de peso aos 205 e 365 dias de idade de animais Nelore. Os componentes de variância de linhagem citoplasmática foram iguais a 0,58x10-3 para peso aos 205 dias e 0,80x10-3 para o peso aos 365 dias e contribuíram com 1,00x10-5 por cento e 9,90x10-6 por cento da variância fenotípica total. Os componentes de variância aditivo direto foram responsáveis por 11 e 21 por cento da variação fenotípica total dos pesos aos 205 e 365 dias de idade


Records on 769,925 Nelore animals born from 1965 to 2000, in 30 regions of Brazil were used as base data to develop a flexible a ease use computational program for identifying maternal base lines in herds, allowing filter by country, state, region and herd. The Center-West region was selected for a detailed study of cytoplasmatic lines on weaning and yearling weights of Nelore animals. The estimated variance components for citoplasmatic lines were .58 x 10-3 and .80 x 10-.8 for weaning and yearling weights, respectively, and accounted for 1.00x10-5 and 9.90x10-6 of total weights variance, respectively. The direct additive component accounts for 11 and 12 percent of the total phenotypic variance of weaning and yearling weights


Subject(s)
Animals , Cattle , Cattle/genetics , Extrachromosomal Inheritance , Software , Weaning , Weight by Age
5.
Genet. mol. biol ; 28(3): 357-362, July-Sept. 2005. tab
Article in English | LILACS | ID: lil-416310

ABSTRACT

The influence of cytoplasmic inheritance on birth and weaning weight was evaluated in an experimental Hereford herd. Data on 1,720 records for birth and weaning weights from calves born between 1963 and 2002 were studied. Variance components were estimated using MTDFREML procedures and an animal model was fitted for each trait. Direct and maternal additive effects and permanent environment and maternal lineage effects were treated as random, while year and month of birth, age of dam and sex of the calf were treated as fixed. Identification of maternal lineages was based on pedigree information. The contribution to phenotypic variance of cytoplasmic lineages defined by pedigree information was negligible for both traits. Mitochondrial genotypes of cows present in the herd in 2002 were analyzed by single strand conformation polymorphism (SSCP) analysis. Only five different genotypes were identified among 23 maternal lineages. All the animals with records were assigned to maternal genotypes based on pedigree information. The statistical analysis was repeated, removing maternal lineage from the model and including mitochondrial genotype as a fixed effect. No evidence of genotype effects was detected. These results suggest a negligible effect of the mitochondrial genome on the preweaning traits of this Hereford herd.


Subject(s)
Animals , Birth Weight , Cattle/genetics , Extrachromosomal Inheritance , Polymorphism, Single-Stranded Conformational , Weaning
6.
J Biosci ; 2003 Sep; 28(5): 623-36
Article in English | IMSEAR | ID: sea-111238

ABSTRACT

Extrachromosomal or chromosomally integrated genetic elements are common among prokaryotic and eukaryotic cells. These elements exhibit a variety of 'selfish' strategies to ensure their replication and propagation during the growth of their host cells. To establish long-term persistence, they have to moderate the degree of selfishness so as not to imperil the fitness of their hosts. Earlier genetic and biochemical studies together with more recent cell biological investigations have revealed details of the partitioning mechanisms employed by low copy bacterial plasmids. At least some bacterial chromosomes also appear to rely on similar mechanisms for their own segregation. The 2 mm plasmid of Saccharomyces cerevisiae and related yeast plasmids provide models for optimized eukaryotic selfish DNA elements. Selfish DNA elements exploit the genetic endowments of their hosts without imposing an undue metabolic burden on them. The partitioning systems of these plasmids appear to make use of a molecular trick by which the plasmids feed into the segregation pathway established for the host chromosomes.


Subject(s)
Cell Cycle Proteins , Chromosomal Proteins, Non-Histone , Chromosome Segregation , Chromosomes, Bacterial , DNA Replication , DNA, Fungal , Extrachromosomal Inheritance , Fungal Proteins , Genome , Nuclear Proteins/metabolism , Plasmids , Saccharomyces cerevisiae/genetics
7.
J. bras. nefrol ; 25(1): 46-50, mar. 2003. ilus, tab
Article in Portuguese | LILACS | ID: lil-364819

ABSTRACT

A ocorrência familiar de glomeruloscierose segmentar e focal (GESF) vem sendo relatada na literatura e atualmente é a lesão histopatológica mais freqüente entre pacientes com síndrome nefrática familiar. Tanto a herança autossômica dominante quanto a herança autossômica recessiva já foram descritas. A doença caracteriza-se por pobre resposta ao tratamento com corticóide, evoluçãovariável para insuficiência renal crônica (IRC) e ausênciade recorrência no transplante renal. Os autores fazem uma revisão dos aspectos clínicos da GESF familiar e chamam a atenção para a importância deste diagnóstico. Vinte e nove membros de uma família brasileira (três gerações) com GESF familiar foram investigados e o estudo genético encontrou associação com o gene N PHS2 localizado no cromossomo 1 q25-3 1.


Subject(s)
Humans , Male , Female , Adult , Biopsy , Chromosome Mapping , Extrachromosomal Inheritance , Glomerulosclerosis, Focal Segmental , Kidney , Nephrotic Syndrome , Proteinuria
8.
Rev. méd. Hosp. Gen. Méx ; 60(4): 188-95, oct.-dic. 1997. ilus
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-225134

ABSTRACT

Actualmente, la genética moderna se considera una disciplina central en el estudio de la variabilidad y la herencia humana; ha permitido el entendimiento de muchas enfermedades de las diferentes áreas médicas y en un futuro se esperan importantes logros. El modelo de herencia mendeliana en la que rasgos dominantes y recesivos se transmiten de acuerdo a la segregación cromosómica es la base del conocimiento de las enfermedades genéticas. Sin embargo, muchos clínicos se encuentran con familias cuya historia genética no se explica fácilmente por este esquema. La genética molecular ha revelado nuevos mecanismos acerca de la herencia humana que permite explicar esta ®herencia no tradicional¼, la cual incluye principalmente: el mosaicismo, herencia mitocondrial, impronta genómica, disomía uniparental y enfermedades por trinucleótidos de repetición


Subject(s)
Phenylalanine/deficiency , Phenylalanine/genetics , Chromosome Aberrations/physiopathology , Chromosome Aberrations/genetics , Heterozygote , Molecular Biology/trends , Genetic Carrier Screening/methods , Genetics, Medical , Extrachromosomal Inheritance/physiology , Extrachromosomal Inheritance/genetics
9.
Rev. méd. Hosp. Gen. Méx ; 60(4): 206-12, oct.-dic. 1997.
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-225136

ABSTRACT

La existencia de mutaciones en línea germinal en los genes BRCA1 y BRCA2 que confieren susceptibilidad familiar para el desarrollo del cáncer de la mama constituye un avance de gran importancia para el estudio de la historia natural de la enfermedad. Las mutaciones en BRCA1 también predisponen para el desarrollo de tumores malignos del ovario lo que determina que sea posible encontrar en una misma familia mujeres que padecen cáncer de mama cáncer de ovario o con menor frecuencia, los dos tumores. El producto de BRCA2, el otro gen de susceptibilidad para el cáncer de mama, tiene propiedades funcionales distintas como lo demuestra la rareza del cáncer del ovario y su asociación con el cáncer mamario en varones. El análisis genético de otros tumores malignos ha revelado que mutaciones BRCA1 o en BRCA2 también son predisponentes. Es importante mencionar que 30 por ciento de los tumores con antecedentes hereditarios no tienen mutaciones en BRCa1 o en BRCA2 lo que sugiere que existen otros genes que confieren susceptibilidad para el cáncer de mama


Subject(s)
Oncogenes/genetics , Breast Neoplasms/physiopathology , Breast Neoplasms/genetics , Heterozygote , Extrachromosomal Inheritance/genetics
10.
São Paulo med. j ; 114(1): 1068-72, Jan.-Feb. 1996. ilus, tab
Article in English | LILACS | ID: lil-173535

ABSTRACT

High frequency transfer and elimination of drug resistance may indicate an extrachromosomal inheritance of genetic determinants. This study shows the cure and transfer of a small plasmid and tetracycline resistance in Staphylococcus aureus 1030 (55) Tetr strains. Several methods are available for plasmid elimination. We used ethidium bromide, an agent that binds to DNA, and thus inhibits DNA polymerase. This caused a high frequency of loss of the small plasmid and resistance to tetracycline. Transfer of tetracycline resistance was done in a mixed culture at a frequency of 10(-6). This type of study is very important to physicians and epidemiology investigators and provides better knowledge on antibiotic-resistance mechanisms that may occur in vivo in a hospital environment.


Subject(s)
Staphylococcus aureus/genetics , Gene Transfer Techniques , Plasmids/genetics , Tetracycline Resistance , Staphylococcus aureus/drug effects , Tetracycline/pharmacology , Streptomycin/pharmacology , Ethidium , Extrachromosomal Inheritance , Conjugation, Genetic , Plasmids/isolation & purification
12.
Egyptian Orthopaedic Journal [The]. 1992; 6 (1): 45-59
in English | IMEMR | ID: emr-23805
13.
Monography in Spanish | LILACS | ID: lil-124032

ABSTRACT

En este trabajo revisaremos la herencia estracromosomica de Salmonella typhimurium, dando especial énfasis al examen de las propiedades generales de los plásmidos crípticos del tipo pSLT y de aquellos que han sido identificados y clasificados dentro del grupo de incompatibildad HI2, de interés epidemiológico los cuales han sido objeto de estudio en nuestro laboratorio en los últimos 15 años. Aunque, por lo extenso del tema, resulta imposible analizar cada uno de los plásmidos que han sido identificados en S. Typhimurium, se examinarán las propiedades más importantes de los prototipos mejor estudiados, se discutirán las interacciones con otros plásmidos transmisibles a S. Typhimurium y se comparán sus propiedades cuando sea pertinente


Subject(s)
Extrachromosomal Inheritance , Salmonella typhimurium
16.
Hindustan Antibiot Bull ; 1979 Feb; 21(3): 92-101
Article in English | IMSEAR | ID: sea-2611
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